千禧大厦三楼罗克西·勒弗戈尔大厅
研究生院是该地区领先的教育机构，面向寻求成为致力于国家建设的专业和道德领袖的学生。
研究生院的课程让学生接触到不同的地方和全球视角，在顶尖教师、研究专家和行业从业者的支持下，促进他们的学习。学生接受培训，为教育、商业和工业开发开拓性、创新性和变革性的想法和解决方案。
多年来，硕士和博士课程的毕业生在学术界、私营公司、政府和非政府组织中担任重要职务，为国家和区域发展提供资源。
更重要的是，该机构提供的项目坚持卫斯理传统的社区建设服务，学术卓越奖学金，通过专业和精神成长的性格。
它以提供被基督教学校、学院和大学协会授予三级认证的课程为荣，这些课程是教育博士、教育硕士、工商管理硕士和护理硕士。还提供文学硕士、教育硕士、科学硕士和哲学博士的专业课程；以及高等教育委员会(CHED)新批准的项目，即与圣托马斯大学（Santo Tomas）合作的药学硕士项目，以及与何塞·里扎尔大学（Jose Rizal University）合作的创业、酒店和餐厅管理工商管理硕士项目。
为了加强与CHED的伙伴关系，威斯里安大学向寻求CHED奖学金的研究生提供援助。在促进高质量高等教育的任务中，CHED为在学术上表现出色的研究生提供奖学金项目。
研究生院项目
教育管理教育博士 EdD in Educational Management
工商管理博士 PhD in Business Administration
幼儿教育专业教育硕士 MA in Education major in Early Childhood Education
教育管理专业教育硕士 MA in Education major in Educational Management
教育心理学教育专业硕士 MA in Education major in Educational Psychology
教育领导与监督专业教育硕士 MA in Education major in Educational Leadership and Supervision
英语教育专业硕士 MA in Education major in English
英语教学教育专业硕士 MA in Education major in English Language Teaching
菲律宾语教育专业硕士 MA in Education major in Filipino
普通科学教育专业硕士 MA in Education major in General Science
教育硕士，主修指导和咨询 MA in Education major in Guidance and Counseling
数学教育专业硕士 MA in Education major in Mathematics
家政学教育专业硕士 MA in Education major in Home Economics
教学设计与技术教育专业硕士 MA in Education major in Instructional Design and Technology
社会研究教育专业硕士 MA in Education major in Social Studies
社会学硕士 MA in Sociology
工商管理硕士(带论文) Master in Business Administration (with Thesis)
工商管理硕士(非论文) Master in Business Administration (non Thesis)
酒店及餐厅管理专业工商管理硕士 MBA major in Hotel and Restaurant Management
社会企业家和管理专业工商管理硕士 MBA major in Social Entrepreneurship and Management
犯罪学专业刑事司法教育硕士 Master in Criminal Justice Education major in Criminology
医院管理硕士 Master in Hospital Administration
公共管理硕士(论文) Master in Public Administration (with Thesis)
公共管理硕士(非论文) Master in Public Administration (non Thesis)
社会工作硕士 Master in Social Work
